医药纯化水设备主要在医疗行业使用比较多，大多数是一些在使用，由于人体口服药物对于生产环境的限制，所以在生产和使用方面也是非常注重环境问题，不论是使用的原材料还是设备生产器材，都需要出于无菌环境。在生产过程中，水质的要求是非常严格的，而现在医药厂主要用水都是使用反渗透法进行制取超纯水，采用连续电去离子技术（简称“EDI”）后，使得医药行业摒弃了之前采用的伴生废酸、废碱污染的传统离子交换技术，使得现在的医药行业实现全自动化，能连续生产，并且减少也过程中的污染问题。
医药纯化水设备
GMP认证制药用水要求：
一、制药用水分类及水质标准
制药用水(工艺用水)：药品生产工艺中使用的水，包括饮用水、纯化水、注射用水分类：
1）饮用水（Potable-Water）：通常为自来水公司供应的自来水 或深井水，又称原水，其质量必须符合标准GB5749-85《生活饮用水卫生标准》。按2000中国药典规定，饮用水不能直接用作制剂的制备或试验用水。
2）纯化水（Purified Water）：为原水经蒸馏法、离子交换法、反渗透法或其他适宜的方法制得的制药用的水、不含附加剂。 纯化水可作为配制普通药物制剂的溶剂或试验用水，不得用于注射剂的配制 。采用离子交换法、反渗透法、超滤法等非热处理制备的纯化水一般又称去离子水。采用特殊设计的蒸馏器用蒸馏法制备的纯化水一般又称蒸馏水。
3）注射用水（Water for Injection）：是以纯化水作为原水，经特殊设计的蒸馏器蒸馏冷凝冷却后经膜过滤制备而得的水。
注射用水可作为配制注射剂用的溶剂。
灭菌注射用水（Sterile Water for Injection）：
为射用水依照注射剂生产工艺制备所得的水。灭菌注射用水用于灭菌粉末的溶剂或注射液的稀释剂。
2、制药用水的水质标准
1）饮用水：应符合中华人民共和国标准《生活饮用水卫生标准》（GB5749-85）
2） 纯化水：应符合《2000中国药典》所收载的纯化水标准。在制水工艺中通常采用在线检测纯化水的电阻率值的大小，来反映水中各种离子的浓度。制药行业的纯化水的电阻率通常应≥0.5MΩ.CM/25℃,对于注射剂、滴眼液容器冲洗用的纯化水的电阻率应≥1MΩ.CM/25℃。3） 注射用水：应符合2000中国药典所收载的注射用水标准 。
医药纯化水系统
一旦涉及到医药行业用超纯水机，就必须符合中国药典规定才能进行生产，而在使用材料上也有着严格的规定，在药典第31条至第37条中都有着明确的规定，要求药厂对设备的材料、生产工艺、温度、制作流程等都有严格的规定，只有符合这些工艺条件才能进行药品制作与生产。
在医药行业的EDI上也有着明确的材料要求，1.输水泵纯化水输送泵采用316L不锈钢（浸泡部分），电抛光钝化处理；卫生夹头作连接件；润滑剂采用纯化水；可完全排除积水。2.由于紫外线激发的255nm波长的光强与时间成反比，因此要求有记录时间的仪表和光强度仪表，其浸水部分采用316L不锈钢，石英灯罩可拆卸。
对于医药行业超纯水机，无菌的要求要比化工行业要严格很多，在输水管道上需要采用不锈钢并且定期消毒，不锈钢的焊接点必须进行抛光处理，红外焊接等工艺，在消毒上也不能使用化工材料消毒，只能采用高温等非化工消毒方式，这样才能确保制作药品的安全性。